Pada tahun 1991, Muklas, atas perintah Abdullah Sungkar dan Abu Bakar Bashir diasaskan [Lukmanul Hakiem]], pesantren atausekolah berasrama Islam "berdasarkan sekolah lamadi Ngruki. Ia telah dicipta untuk menghubungkan dengan lain-lain Madrassah dan berkhidmat untuk merekrut masa hadapan pengjihad. Lukmanul Hakiem bekerja Noordin Mohammad Top, seorang warga Malaysia, sebagai prinsipal sekolah dan beliau menggunakan peranan ini untuk melantik Muhammad Rais dan lain-lain bagi pengeboman Marriott Hotel 2003 di Jakarta.

Abu Bakar Bashir, Abdullah Sungkar, Muklas, Noordin Top, semua yang diajar di sekolah. Pembuat bom JI Azahari Husin disampaikan kepada lembaga pengarah. Top Noordin telah dinaikkan pangkat kepada pengarah, apabila undang-undang Malaysia telah dilaraskan, bagaimanapun Muklas terus beroperasi sebagai pemimpin melalui proksi.[3]